Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FNTAP49354 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FNTAP49354 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FNTAP49354 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FNTAP49354 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FNTAP49354 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FNTAP49354 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FNTAP49354 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FNTAP49354 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FNTAP49354 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FNTAP49354 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FNTAP49354 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FNTAP49354 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FNTAP49354 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FNTAP49354 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms