Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBRP36941 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBRP36941 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBRP36941 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBRP36941 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBRP36941 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBRP36941 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBRP36941 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBRP36941 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBRP36941 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBRP36941 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBRP36941 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBRP36941 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBRP36941 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBRP36941 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBRP36941 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBRP36941 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBRP36941 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBRP36941 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBRP36941 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBRP36941 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBRP36941 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBRP36941 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBRP36941 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBRP36941 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBRP36941 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBRP36941 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LTBRP36941 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBRP36941 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBRP36941 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBRP36941 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBRP36941 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBRP36941 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBRP36941 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBRP36941 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBRP36941 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBRP36941 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBRP36941 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBRP36941 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBRP36941 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBRP36941 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBRP36941 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBRP36941 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBRP36941 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBRP36941 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBRP36941 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBRP36941 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBRP36941 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBRP36941 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBRP36941 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBRP36941 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBRP36941 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBRP36941 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBRP36941 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LTBRP36941 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBRP36941 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBRP36941 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBRP36941 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBRP36941 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBRP36941 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBRP36941 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBRP36941 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBRP36941 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBRP36941 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBRP36941 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBRP36941 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBRP36941 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBRP36941 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBRP36941 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBRP36941 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBRP36941 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBRP36941 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBRP36941 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBRP36941 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBRP36941 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LTBRP36941 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBRP36941 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBRP36941 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBRP36941 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBRP36941 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBRP36941 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBRP36941 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBRP36941 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBRP36941 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBRP36941 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBRP36941 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBRP36941 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBRP36941 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBRP36941 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBRP36941 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBRP36941 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBRP36941 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBRP36941 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBRP36941 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBRP36941 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBRP36941 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBRP36941 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBRP36941 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBRP36941 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBRP36941 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms