Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJA4P35212 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJA4P35212 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJA4P35212 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJA4P35212 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA4P35212 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA4P35212 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA4P35212 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA4P35212 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA4P35212 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA4P35212 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA4P35212 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA4P35212 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA4P35212 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA4P35212 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA4P35212 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA4P35212 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA4P35212 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA4P35212 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA4P35212 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA4P35212 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA4P35212 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA4P35212 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA4P35212 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA4P35212 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA4P35212 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA4P35212 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA4P35212 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA4P35212 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms