Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD1P28340 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD1P28340 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD1P28340 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD1P28340 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD1P28340 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD1P28340 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD1P28340 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD1P28340 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD1P28340 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD1P28340 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD1P28340 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD1P28340 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLD1P28340 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLD1P28340 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD1P28340 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD1P28340 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD1P28340 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD1P28340 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD1P28340 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD1P28340 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD1P28340 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD1P28340 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD1P28340 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD1P28340 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD1P28340 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD1P28340 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD1P28340 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD1P28340 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD1P28340 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD1P28340 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD1P28340 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD1P28340 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD1P28340 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD1P28340 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLD1P28340 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD1P28340 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD1P28340 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD1P28340 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD1P28340 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD1P28340 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD1P28340 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD1P28340 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD1P28340 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD1P28340 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD1P28340 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD1P28340 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD1P28340 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD1P28340 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD1P28340 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD1P28340 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD1P28340 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD1P28340 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD1P28340 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD1P28340 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD1P28340 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD1P28340 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD1P28340 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD1P28340 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD1P28340 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLD1P28340 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLD1P28340 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLD1P28340 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLD1P28340 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLD1P28340 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLD1P28340 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLD1P28340 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLD1P28340 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLD1P28340 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLD1P28340 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLD1P28340 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLD1P28340 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLD1P28340 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POLD1P28340 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLD1P28340 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLD1P28340 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLD1P28340 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLD1P28340 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD1P28340 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD1P28340 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD1P28340 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD1P28340 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD1P28340 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD1P28340 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD1P28340 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD1P28340 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD1P28340 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD1P28340 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD1P28340 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD1P28340 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD1P28340 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD1P28340 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD1P28340 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD1P28340 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD1P28340 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD1P28340 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD1P28340 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD1P28340 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD1P28340 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLD1P28340 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms