Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms