Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EGR1P18146 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EGR1P18146 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EGR1P18146 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EGR1P18146 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EGR1P18146 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms