Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPI1P17947 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPI1P17947 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPI1P17947 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPI1P17947 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPI1P17947 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPI1P17947 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPI1P17947 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPI1P17947 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPI1P17947 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPI1P17947 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPI1P17947 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPI1P17947 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPI1P17947 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPI1P17947 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPI1P17947 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPI1P17947 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPI1P17947 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPI1P17947 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPI1P17947 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPI1P17947 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPI1P17947 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPI1P17947 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPI1P17947 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms