Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VPREB1P12018 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms