Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NR2F1P10589 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NR2F1P10589 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms