Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GLI4P10075 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GLI4P10075 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GLI4P10075 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GLI4P10075 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GLI4P10075 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GLI4P10075 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GLI4P10075 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GLI4P10075 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GLI4P10075 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GLI4P10075 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GLI4P10075 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GLI4P10075 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GLI4P10075 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GLI4P10075 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI4P10075 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI4P10075 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI4P10075 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI4P10075 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI4P10075 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI4P10075 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI4P10075 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI4P10075 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI4P10075 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI4P10075 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI4P10075 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI4P10075 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI4P10075 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI4P10075 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI4P10075 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI4P10075 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI4P10075 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI4P10075 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI4P10075 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI4P10075 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI4P10075 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI4P10075 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI4P10075 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI4P10075 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI4P10075 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI4P10075 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI4P10075 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GLI4P10075 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms