Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI3P10071 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI3P10071 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI3P10071 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI3P10071 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI3P10071 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI3P10071 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI3P10071 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI3P10071 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI3P10071 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI3P10071 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI3P10071 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI3P10071 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI3P10071 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI3P10071 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLI3P10071 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI3P10071 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI3P10071 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI3P10071 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI3P10071 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI3P10071 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI3P10071 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI3P10071 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI3P10071 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI3P10071 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI3P10071 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI3P10071 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI3P10071 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI3P10071 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI3P10071 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI3P10071 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI3P10071 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI3P10071 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI3P10071 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI3P10071 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI3P10071 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI3P10071 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLI3P10071 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI3P10071 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI3P10071 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI3P10071 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI3P10071 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI3P10071 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI3P10071 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI3P10071 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI3P10071 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI3P10071 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI3P10071 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI3P10071 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI3P10071 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI3P10071 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI3P10071 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI3P10071 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GLI3P10071 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GLI3P10071 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI3P10071 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI3P10071 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI3P10071 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI3P10071 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI3P10071 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI3P10071 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI3P10071 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI3P10071 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI3P10071 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI3P10071 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI3P10071 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI3P10071 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI3P10071 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI3P10071 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI3P10071 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI3P10071 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI3P10071 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI3P10071 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI3P10071 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI3P10071 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI3P10071 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI3P10071 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI3P10071 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI3P10071 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI3P10071 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI3P10071 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI3P10071 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI3P10071 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI3P10071 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI3P10071 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI3P10071 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI3P10071 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI3P10071 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI3P10071 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI3P10071 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI3P10071 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI3P10071 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI3P10071 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI3P10071 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI3P10071 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI3P10071 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI3P10071 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI3P10071 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI3P10071 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI3P10071 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms