Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB1P08034 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJB1P08034 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB1P08034 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB1P08034 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB1P08034 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB1P08034 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB1P08034 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB1P08034 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB1P08034 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB1P08034 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB1P08034 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB1P08034 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB1P08034 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB1P08034 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB1P08034 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB1P08034 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB1P08034 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB1P08034 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB1P08034 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB1P08034 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB1P08034 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB1P08034 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB1P08034 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB1P08034 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB1P08034 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB1P08034 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB1P08034 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB1P08034 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJB1P08034 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GJB1P08034 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
GJB1P08034 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB1P08034 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB1P08034 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB1P08034 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB1P08034 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB1P08034 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB1P08034 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB1P08034 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB1P08034 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB1P08034 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB1P08034 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB1P08034 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB1P08034 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB1P08034 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB1P08034 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB1P08034 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB1P08034 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB1P08034 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB1P08034 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB1P08034 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJB1P08034 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJB1P08034 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms