Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC1P02654 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC1P02654 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC1P02654 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC1P02654 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms