Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PITX3O75364 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PITX3O75364 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PITX3O75364 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PITX3O75364 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PITX3O75364 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PITX3O75364 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PITX3O75364 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PITX3O75364 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PITX3O75364 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PITX3O75364 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PITX3O75364 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX3O75364 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX3O75364 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX3O75364 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX3O75364 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX3O75364 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX3O75364 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX3O75364 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX3O75364 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX3O75364 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX3O75364 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX3O75364 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX3O75364 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX3O75364 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX3O75364 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX3O75364 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX3O75364 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX3O75364 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX3O75364 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX3O75364 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX3O75364 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX3O75364 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX3O75364 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX3O75364 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX3O75364 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX3O75364 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX3O75364 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX3O75364 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX3O75364 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX3O75364 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX3O75364 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX3O75364 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PITX3O75364 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PITX3O75364 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PITX3O75364 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PITX3O75364 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PITX3O75364 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PITX3O75364 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PITX3O75364 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX3O75364 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX3O75364 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX3O75364 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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