Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM200CA6NKL6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms