Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HMX3A6NHT5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms