Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJA3Q9Y6H8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms