Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GTF3C3Q9Y5Q9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms