Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC8Q9Y2L5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms