Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUDCQ9Y266 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUDCQ9Y266 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms