Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FZD4Q9ULV1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FZD4Q9ULV1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms