Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TVP23BQ9NYZ1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TVP23BQ9NYZ1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TVP23BQ9NYZ1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TVP23BQ9NYZ1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TVP23BQ9NYZ1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TVP23BQ9NYZ1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TVP23BQ9NYZ1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms