Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ASF1BQ9NVP2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms