Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC7Q96M83 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC7Q96M83 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms