Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNFT2Q96EX2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms