Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms