Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX54Q8TDD1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms