Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF123Q5XPI4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms