Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLHL22Q53GT1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms