Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIF1AQ16665 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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