Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCN1BQ07699 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCN1BQ07699 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms