Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP1Q04837 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms