Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF9Q00978 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms