Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPCS3P61009 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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