Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM4P49221 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM4P49221 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM4P49221 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM4P49221 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM4P49221 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM4P49221 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM4P49221 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM4P49221 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM4P49221 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM4P49221 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM4P49221 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM4P49221 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM4P49221 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM4P49221 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM4P49221 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM4P49221 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM4P49221 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM4P49221 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM4P49221 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM4P49221 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM4P49221 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM4P49221 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM4P49221 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM4P49221 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM4P49221 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM4P49221 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM4P49221 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM4P49221 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM4P49221 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM4P49221 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM4P49221 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM4P49221 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM4P49221 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM4P49221 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM4P49221 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM4P49221 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM4P49221 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM4P49221 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM4P49221 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM4P49221 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM4P49221 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM4P49221 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM4P49221 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM4P49221 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM4P49221 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM4P49221 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms