Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARCKSP29966 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms