Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DQB1P01920 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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