Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

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Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COCHO43405 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COCHO43405 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COCHO43405 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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