Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SIAH2O43255 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms