Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLOCKO15516 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLOCKO15516 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms