Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSDA5PKW4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSDA5PKW4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms