Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms