Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATF5Q9Y2D1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF5Q9Y2D1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms