Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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PTPRQQ9UMZ3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTPRQQ9UMZ3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTPRQQ9UMZ3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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