Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAE1Q9UBE0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAE1Q9UBE0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms