Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms