Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRN3Q9H3W5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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