Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FYCO1Q9BQS8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FYCO1Q9BQS8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms