Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD27Q96NW4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms