Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CAPNS2Q96L46 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CAPNS2Q96L46 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
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